Via het grondwater komt de vervuiling nu in het kanaal. Het advies geldt al langer om geen vis uit het kanaal te eten. Zwemmen was er al verboden.

HCH is een bestanddeel van het bestrijdingsmiddel Lindaan dat werd geproduceerd van 1948 tot 1952 in een voormalige fabriek van Stork-Chemie. HCH komt in lagere concentraties al langer voor in het Twentekanaal, vanwege bekende bodemverontreinigingen. Er is nu echter sprake van een verhoogde concentratie. Door te spoelen zal de concentratie afnemen en richting het IJsselmeer steeds verder verdunnen. Via gemaal Eefde wordt water uit de IJssel omhoog gepompt. Vervolgens stroomt het water via Delden-Almelo-Kanaal Almelo-De Haandrik-Vecht-Zwarte Water naar het IJsselmeer. Het doorspoelen duurt ongeveer twee tot drie weken.